O Instituto de Biologia Roberto Alcantara Gomes (IBRAG) funciona em dois pavilhões da UERJ. No Pavilhão Américo Piquet Carneiro (PAPC), situado na rua Prof. Manoel de Abreu, 444, Vila Isabel, localiza-se no primeiro andar a Direção do IBRAG, a Secretaria de Graduação, o Departamento de Anatomia Humana (DAn) e o Laboratório de Microscopia Eletrônica. No segundo andar, localiza-se a Biblioteca. No terceiro andar localiza-se o Departamento de Histologia e Embriologia (DHE). No quarto andar, dois Departamentos: o de Bioquímica (DBq) e o de Biofísica e Biometria (DBB). No quinto andar o Departamento de Farmacologia e Psicobiologia (DFP) e o de Ciências Fisiológicas (DCF).
No Pavilhão Haroldo Lisboa da Cunha (PHLC), situado no Campus Maracanã, na Rua São Francisco Xavier, 524, Maracanã, abriga no primeiro andar, o Departamento de Ciências Radiológicas (DCR) e os laboratórios LDD e Biovasc. No segundo andar, as secretarias e salas de aula dos Departamentos de Biologia Celular (DBCel), Genética (DGen), Ecologia (Decol), Biologia Vegetal (DBV) e Zoologia (DZ). No quinto andar localizam-se laboratórios de pesquisa e o Departamento de Ensino de Ciências e Biologia (DECB).
Atividades práticas de campo do ciclo básico e de algumas disciplinas do ciclo profissional, além de pesquisas e projetos de extensão, também são realizados no Campus Ilha Grande (CEADS - Centro de Estudos Ambientais e Desenvolvimento Sustentável).
Pavilhão Américo Piquet Carneiro (PAPC)
Pavilhão Haroldo Lisboa da Cunha (PHLC)
